Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSCO60682 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSCO60682 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSCO60682 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSCO60682 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSCO60682 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSCO60682 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms