Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH6O60337 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms