Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms