Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DENRO43583 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DENRO43583 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DENRO43583 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DENRO43583 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DENRO43583 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms