Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HOXA3O43365 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HOXA3O43365 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HOXA3O43365 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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HOXA3O43365 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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