Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRODHO43272 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRODHO43272 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRODHO43272 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRODHO43272 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRODHO43272 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRODHO43272 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRODHO43272 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms