Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms