Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms