Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNMO15061 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNMO15061 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNMO15061 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNMO15061 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNMO15061 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNMO15061 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNMO15061 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNMO15061 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNMO15061 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNMO15061 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNMO15061 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNMO15061 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNMO15061 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNMO15061 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNMO15061 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNMO15061 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNMO15061 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNMO15061 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms