Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms