Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms