Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DEV8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DEV8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DEV8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms