Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCNX2A6NKB5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms