Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP5LA4QPB2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRP5LA4QPB2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms