Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCHNA4D1U4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LCHNA4D1U4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms