Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPDC1A2A3K4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms