Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms