Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRRAPQ9Y4A5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRRAPQ9Y4A5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRRAPQ9Y4A5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRRAPQ9Y4A5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRRAPQ9Y4A5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRRAPQ9Y4A5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRRAPQ9Y4A5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRRAPQ9Y4A5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms