Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR3KQ9Y2Y1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3KQ9Y2Y1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3KQ9Y2Y1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3KQ9Y2Y1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms