Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A2Q9UPR5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A2Q9UPR5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A2Q9UPR5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC8A2Q9UPR5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A2Q9UPR5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC8A2Q9UPR5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC8A2Q9UPR5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A2Q9UPR5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC8A2Q9UPR5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC8A2Q9UPR5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms