Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN67

PCDHB10, Protocadherin beta-10, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB10Q9UN67 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB10Q9UN67 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB10Q9UN67 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB10Q9UN67 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms