Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA11Q9UKX5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA11Q9UKX5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA11Q9UKX5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA11Q9UKX5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA11Q9UKX5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms