Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CPA4Q9UI42 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPA4Q9UI42 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CPA4Q9UI42 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPA4Q9UI42 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
CPA4Q9UI42 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CPA4Q9UI42 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms