Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PUF60Q9UHX1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PUF60Q9UHX1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PUF60Q9UHX1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PUF60Q9UHX1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PUF60Q9UHX1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUF60Q9UHX1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms