Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNN3Q9UGI6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN3Q9UGI6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNN3Q9UGI6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms