Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK2Q9UBU2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DKK2Q9UBU2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms