Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KB2Q9UBS0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KB2Q9UBS0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB2Q9UBS0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KB2Q9UBS0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB2Q9UBS0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KB2Q9UBS0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms