Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
HDAC6Q9UBN7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HDAC6Q9UBN7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC6Q9UBN7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDAC6Q9UBN7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.08■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC6Q9UBN7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms