Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPC4Q9UBN4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC4Q9UBN4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPC4Q9UBN4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC4Q9UBN4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms