Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
REREQ9P2R6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
REREQ9P2R6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
REREQ9P2R6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
REREQ9P2R6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
REREQ9P2R6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
REREQ9P2R6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
REREQ9P2R6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
REREQ9P2R6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
REREQ9P2R6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
REREQ9P2R6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
REREQ9P2R6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
REREQ9P2R6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
REREQ9P2R6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
REREQ9P2R6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
REREQ9P2R6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms