Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDP2Q9P2J9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDP2Q9P2J9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDP2Q9P2J9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDP2Q9P2J9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms