Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
USP35Q9P2H5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
USP35Q9P2H5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
USP35Q9P2H5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
USP35Q9P2H5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
USP35Q9P2H5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
USP35Q9P2H5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
USP35Q9P2H5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
USP35Q9P2H5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
USP35Q9P2H5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
USP35Q9P2H5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
USP35Q9P2H5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
USP35Q9P2H5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
USP35Q9P2H5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
USP35Q9P2H5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
USP35Q9P2H5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
USP35Q9P2H5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
USP35Q9P2H5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP35Q9P2H5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
USP35Q9P2H5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms