Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGFRNQ9P2B2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTGFRNQ9P2B2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGFRNQ9P2B2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms