Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.73■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC54.73■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.73■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC54.72■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC54.72■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC54.72■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.72■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC54.71■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC54.71■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC54.7■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.7■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC54.7■■■■■ 6.35
CCDC180Q9P1Z9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.68■■■■■ 6.34
CCDC180Q9P1Z9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC54.67■■■■■ 6.34
CCDC180Q9P1Z9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.66■■■■■ 6.34
CCDC180Q9P1Z9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.66■■■■■ 6.34
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.64■■■■■ 6.34
CCDC180Q9P1Z9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC54.63■■■■■ 6.34
CCDC180Q9P1Z9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.62■■■■■ 6.34
CCDC180Q9P1Z9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC54.62■■■■■ 6.34
CCDC180Q9P1Z9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.61■■■■■ 6.33
CCDC180Q9P1Z9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC54.61■■■■■ 6.33
CCDC180Q9P1Z9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC54.61■■■■■ 6.33
CCDC180Q9P1Z9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.6■■■■■ 6.33
CCDC180Q9P1Z9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC54.59■■■■■ 6.33
CCDC180Q9P1Z9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC54.59■■■■■ 6.33
CCDC180Q9P1Z9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC54.58■■■■■ 6.33
CCDC180Q9P1Z9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC54.57■■■■■ 6.33
CCDC180Q9P1Z9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.56■■■■■ 6.33
CCDC180Q9P1Z9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC54.56■■■■■ 6.33
CCDC180Q9P1Z9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.56■■■■■ 6.33
CCDC180Q9P1Z9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.54■■■■■ 6.32
CCDC180Q9P1Z9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.54■■■■■ 6.32
CCDC180Q9P1Z9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC54.52■■■■■ 6.32
CCDC180Q9P1Z9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
CCDC180Q9P1Z9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
CCDC180Q9P1Z9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC54.52■■■■■ 6.32
CCDC180Q9P1Z9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC54.51■■■■■ 6.32
CCDC180Q9P1Z9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC54.51■■■■■ 6.32
CCDC180Q9P1Z9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.5■■■■■ 6.31
CCDC180Q9P1Z9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
CCDC180Q9P1Z9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.48■■■■■ 6.31
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
CCDC180Q9P1Z9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.48■■■■■ 6.31
CCDC180Q9P1Z9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC54.48■■■■■ 6.31
CCDC180Q9P1Z9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
CCDC180Q9P1Z9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC54.47■■■■■ 6.31
CCDC180Q9P1Z9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.46■■■■■ 6.31
CCDC180Q9P1Z9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.44■■■■■ 6.31
CCDC180Q9P1Z9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC54.43■■■■■ 6.3
CCDC180Q9P1Z9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
CCDC180Q9P1Z9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC54.41■■■■■ 6.3
CCDC180Q9P1Z9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC54.41■■■■■ 6.3
CCDC180Q9P1Z9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
CCDC180Q9P1Z9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC54.39■■■■■ 6.3
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.38■■■■■ 6.3
CCDC180Q9P1Z9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC54.38■■■■■ 6.3
CCDC180Q9P1Z9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.36■■■■■ 6.29
CCDC180Q9P1Z9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC54.36■■■■■ 6.29
CCDC180Q9P1Z9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC54.35■■■■■ 6.29
CCDC180Q9P1Z9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC54.35■■■■■ 6.29
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.34■■■■■ 6.29
CCDC180Q9P1Z9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
CCDC180Q9P1Z9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
CCDC180Q9P1Z9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
CCDC180Q9P1Z9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
CCDC180Q9P1Z9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.32■■■■■ 6.29
CCDC180Q9P1Z9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC54.32■■■■■ 6.29
CCDC180Q9P1Z9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC54.3■■■■■ 6.28
CCDC180Q9P1Z9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.28■■■■■ 6.28
CCDC180Q9P1Z9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC54.28■■■■■ 6.28
CCDC180Q9P1Z9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC54.28■■■■■ 6.28
CCDC180Q9P1Z9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
CCDC180Q9P1Z9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.26■■■■■ 6.28
CCDC180Q9P1Z9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC54.26■■■■■ 6.28
CCDC180Q9P1Z9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
CCDC180Q9P1Z9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC54.26■■■■■ 6.28
CCDC180Q9P1Z9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC54.25■■■■■ 6.28
CCDC180Q9P1Z9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC54.24■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC54.24■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC54.23■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC54.23■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC54.23■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC54.22■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.22■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC54.22■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC54.22■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC54.21■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC54.21■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC54.2■■■■■ 6.27
CCDC180Q9P1Z9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC54.19■■■■■ 6.26
CCDC180Q9P1Z9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC54.17■■■■■ 6.26
CCDC180Q9P1Z9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC54.17■■■■■ 6.26
CCDC180Q9P1Z9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC54.16■■■■■ 6.26
CCDC180Q9P1Z9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.15■■■■■ 6.26
CCDC180Q9P1Z9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.15■■■■■ 6.26
CCDC180Q9P1Z9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC54.15■■■■■ 6.26
CCDC180Q9P1Z9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC54.15■■■■■ 6.26
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.13■■■■■ 6.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms