Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN3Q9P1Z3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCN3Q9P1Z3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN3Q9P1Z3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCN3Q9P1Z3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN3Q9P1Z3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms