Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms