Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TFCP2L1Q9NZI6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TFCP2L1Q9NZI6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TFCP2L1Q9NZI6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TFCP2L1Q9NZI6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TFCP2L1Q9NZI6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TFCP2L1Q9NZI6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TFCP2L1Q9NZI6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TFCP2L1Q9NZI6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TFCP2L1Q9NZI6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TFCP2L1Q9NZI6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TFCP2L1Q9NZI6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TFCP2L1Q9NZI6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TFCP2L1Q9NZI6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TFCP2L1Q9NZI6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TFCP2L1Q9NZI6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TFCP2L1Q9NZI6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TFCP2L1Q9NZI6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TFCP2L1Q9NZI6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TFCP2L1Q9NZI6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TFCP2L1Q9NZI6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TFCP2L1Q9NZI6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TFCP2L1Q9NZI6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TFCP2L1Q9NZI6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TFCP2L1Q9NZI6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TFCP2L1Q9NZI6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TFCP2L1Q9NZI6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TFCP2L1Q9NZI6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TFCP2L1Q9NZI6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TFCP2L1Q9NZI6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TFCP2L1Q9NZI6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TFCP2L1Q9NZI6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TFCP2L1Q9NZI6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TFCP2L1Q9NZI6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TFCP2L1Q9NZI6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TFCP2L1Q9NZI6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TFCP2L1Q9NZI6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TFCP2L1Q9NZI6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TFCP2L1Q9NZI6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TFCP2L1Q9NZI6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TFCP2L1Q9NZI6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TFCP2L1Q9NZI6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TFCP2L1Q9NZI6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TFCP2L1Q9NZI6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TFCP2L1Q9NZI6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms