Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP1Q9NZI2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNIP1Q9NZI2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNIP1Q9NZI2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms