Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL39Q9NYK5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL39Q9NYK5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL39Q9NYK5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms