Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX43Q9NXZ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX43Q9NXZ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
DDX43Q9NXZ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX43Q9NXZ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX43Q9NXZ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX43Q9NXZ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX43Q9NXZ2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.4 ms