Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJC11Q9NVH1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAJC11Q9NVH1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC11Q9NVH1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC11Q9NVH1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC11Q9NVH1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms