Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM39AQ9NV64 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM39AQ9NV64 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39AQ9NV64 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMEM39AQ9NV64 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM39AQ9NV64 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMEM39AQ9NV64 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM39AQ9NV64 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms