Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CISHQ9NSE2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CISHQ9NSE2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CISHQ9NSE2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CISHQ9NSE2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CISHQ9NSE2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CISHQ9NSE2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CISHQ9NSE2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms