Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTPS2Q9NRF8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTPS2Q9NRF8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTPS2Q9NRF8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTPS2Q9NRF8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTPS2Q9NRF8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms