Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO8Q9NRD0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO8Q9NRD0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO8Q9NRD0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO8Q9NRD0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms