Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRPM3Q9HCF6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.34
TRPM3Q9HCF6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRPM3Q9HCF6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRPM3Q9HCF6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
TRPM3Q9HCF6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRPM3Q9HCF6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRPM3Q9HCF6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRPM3Q9HCF6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRPM3Q9HCF6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRPM3Q9HCF6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRPM3Q9HCF6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRPM3Q9HCF6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRPM3Q9HCF6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRPM3Q9HCF6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
TRPM3Q9HCF6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRPM3Q9HCF6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms