Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPR35Q9HC97 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPR35Q9HC97 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPR35Q9HC97 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPR35Q9HC97 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPR35Q9HC97 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPR35Q9HC97 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR35Q9HC97 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR35Q9HC97 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPR35Q9HC97 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR35Q9HC97 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR35Q9HC97 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR35Q9HC97 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR35Q9HC97 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR35Q9HC97 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPR35Q9HC97 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPR35Q9HC97 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPR35Q9HC97 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms