Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM27Q9HBJ8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM27Q9HBJ8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM27Q9HBJ8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms