Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PARVBQ9HBI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARVBQ9HBI1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARVBQ9HBI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARVBQ9HBI1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARVBQ9HBI1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARVBQ9HBI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARVBQ9HBI1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVBQ9HBI1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVBQ9HBI1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVBQ9HBI1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARVBQ9HBI1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARVBQ9HBI1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARVBQ9HBI1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARVBQ9HBI1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARVBQ9HBI1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PARVBQ9HBI1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms