Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV0

GNB4, Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB4Q9HAV0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNB4Q9HAV0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB4Q9HAV0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB4Q9HAV0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB4Q9HAV0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB4Q9HAV0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB4Q9HAV0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB4Q9HAV0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB4Q9HAV0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB4Q9HAV0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GNB4Q9HAV0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB4Q9HAV0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNB4Q9HAV0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms